XIX asrda mikrobiologiya fani sohasida qilingan eng muhim kashfiyotlar fransuz kimyogari va fizigi Lui Paster (1822-1895) faoliyati bilan bog‘liq. U o‘z tajribalari asosida uglevolllarning bijg‘ishi, sutning achishi va shunga o'xshash jarayonlar mikroorganizmlar faoliyati sababli vujudga kelishini isbotladi. L. Pasterning vino hamda pivolarning achib qolishi va pilla qurti kasalliklari sabablarini aniqlab bu mikroblarga qarshi samarali choratadbirlami ishlab chiqishi sanoat va oziq-ovqat mikrobiologiyasining shakllanishiga asos bo'ldi. L. Paster dunyoda birinchi bo‘lib ilmiy izlanishlar natijasida parrandalar vabosi, kuydirgi va quturish kasalliklariiga qarshi vaksina tayyorlash usulini ishlab chiqdi. L. Paster oziq muhitlarga tashqaridan begona mikroorganizmlami tushirmaslik usulini topdi. U anaerob bakteriyalarni aniqladi.