Ab initio modellashtirish, gen ketma-ketligini tahlil qilib, fizik-kimyoviy xossalarga asoslanib, taxminan 50 ta aminokislotali oqsil tuzilishini bashorat qilish imkonini beradi, lekin hisoblash hajmi yuqori. Gen tuzilishini bashorat qilishda mashina o'rganish algoritmlari, xususan, chuqur o'rganish tarmoqlari, 90% dan yuqori aniqlik bilan 1000 ga yaqin genni aniqlash imkonini beradi.